Los temas centrales del criterio organización son la evaluación del funcionamiento general de la institución, que es base para la ejecución de funciones específicas, y de su ambiente sociopsicológico.
Evalúa aquellos aspectos de las instalaciones y los recursos que no se articulan con una función sustantiva específica, sino que generan facilidades para el funcionamiento de toda la institución.
Este indicador se basa en que los profesores son el principal recurso de la institución, en razón de aquello se mide informatización, biblioteca, formación académica, ciudadana y práctica.
Comprende la investigación y el desarrollo experimental, se incluyen tres actividades relacionadas: las publicaciones, la innovación y la capacidad de absorción, que se valoran con transversalidad.

Cuenta con dos subcriterios, cada uno integrado por un indicador, y abarcan el ámbito clásico de la vinculación y una nueva dimensión del accionar externo del instituto: la presencia.